公司章程的修改程序如下：
（一）股东会或者股东大会作出修改公司章程的决议；
（二）公司章程修改未涉及登记事项的，将修改后的公司章程送原公司登记机关备案；
（三）公司章程修改导致登记事项变更的，依法办理变更登记。
二、公司章程应细化、明确、具有可操作性
公司法规定了公司章程的必备内容，也就相关内容做出了原则性的规定。很多中小企业投资者往往认为法律已经规定得很明确了，公司章程照抄就行了。殊不知如此章程就失去了制定的必要性了。实际上，公司章程的作用，就是将这些法律规定的内容细化、使其具有可操作性、符合本公司的实际情况。
另外，规定违反章程的后果以及救济方式也很重要。例如，《公司法》的相关内容规定：“出席会议的股东应当在会议记录上签名。”但如果股东参加会议却拒不在会议记录上签名，那么意味着什么？是认定该股东弃权、反对还是同意？同样的这些问题，也适用于董事会会议的程序等等。
三、法人章程可以对抗善意相对人吗
不可以。
《中华人民共和国民法典》的相关内容规定，依照法律或者法人章程的规定，代表法人从事民事活动的负责人，为法人的法定代表人。
法定代表人以法人名义从事的民事活动，其法律后果由法人承受。
法人章程或者法人权力机构对法定代表人代表权的限制，不得对抗善意相对人。